Projet de la 2e année

Chercheurs du réseau CoVaRR-Net

Anne-Claude Gingras, Institut de recherche Lunenfeld Tanenbaum, Sinai Health System, responsable du pilier 4 : Génomique fonctionnelle et structure-fonction des variants préoccupants et chef de projet

Étienne Caron, Université de Montréal, adjoint du Pilier 4
Darryl Falzarano, Vaccine and Infectious Disease Organization (VIDO), Université de la Saskatchewan, adjoint du Pilier 3
William (Rod) Hardy, Institut de recherche Lunenfeld Tanenbaum, Sinai Health System, membre du Pilier 4
François Jean, Université de la Colombie-Britannique, responsable du Pilier 10
Vivian Liu, Université McGill, membre du Pilier 4
Jason Moffat, Université de Toronto, adjoint du Pilier 4
James Rini, Université de Toronto, adjoint du Pilier 4
Mikko Taipale, Université de Toronto, membre du Pilier 4
Joyce Wilson, Université de la Saskatchewan, membre du Pilier 4
Nozumu Yachie, Université de la Colombie-Britannique, adjoint du Pilier 4

Collaborateurs du réseau CoVaRR-Net

Mark Brockman, Université Simon Fraser, adjoint du Pilier 1
Louis Flamand, Université Laval, directeur du Pilier 3
Jennifer Gommerman, Université de Toronto, coresponsable du Pilier 1
Jason Kindrachuk, Université du Manitoba, adjoint du Pilier 2
Marc-André Langlois, Université d’Ottawa, directeur général de CoVaRR-Net
Samira Mubareka, Centre des sciences et institut de recherche Sunnybrook Health, adjointe du Pilier 2
Nazeem Muhajarine, Université de la Saskatchewan, coresponsable du Pilier 8
Ioannis Ragoussis, Université McGill, responsable du Pilier 5
Angela Rasmussen, Vaccine and Infectious Disease Organization (VIDO), Université de la Saskatchewan, responsable du Pilier 2
Jesse Shapiro, Université McGill, coresponsable du Pilier 6

Collaborateurs

Vinod Chandran, University Health Network
Steven Drews, Société canadienne du sang
Michelle Hladunewich, Hôpital Sunnybrook
Atul Humar, University Health Network
Deepali Kumar, University Health Network
Eric Marcusson, Providence Therapeutics
Allison McGeer, Université de Toronto
Mario Ostrowski, Université de Toronto
Pontus Nordenfelt, Université Lund
Brian Raught, University Health Network
Tania Watts, Université de Toronto
Heidi Wood, Laboratoire national de microbiologie

Résumé simplifié

Notre objectif est d’améliorer les technologies permettant de caractériser la fonction des protéines des variants. Pour ce faire, nous voulons générer des réactifs permettant d’étudier des protéines de variants individuels et de tester les interactions protéine-hôte de variants dans des systèmes isolés.

Pour l’année 2, nous nous concentrerons sur trois objectifs :

  1. Mettre au point la technologie permettant de tester plus d’une protéine de spicule de variant à la fois. Avec les technologies actuelles, un seul variant peut être testé à la fois, ce qui représente une limitation pour comparer les variants et anticiper quelle combinaison de mutations sur la protéine de spicule peut devenir importante pour de futurs variants.
  2. Utiliser des technologies de séquençage de protéines pour étudier comment les fragments de protéines du virus sont présentés aux cellules du système immunitaire (lymphocytes T). Cela nous permettra de mieux comprendre comment les mutations de protéines virales en dehors de la protéine de spicule affectent les interactions avec les protéines de l’hôte.
  3. Utiliser des outils informatiques pour nous aider à prédire quelles protéines de spicule, parmi le vaste répertoire trouvé dans les coronavirus animaux, sont susceptibles de se lier aux récepteurs des coronavirus humains. Ces résultats serviront de base à la préparation à de futures pandémies dérivées de coronavirus.

Budget

Contribution en argent de 625 000 $