Piller 2
Interactions hôte-pathogène
Les personnes atteintes de la COVID-19 peuvent présenter un vaste éventail de symptômes, allant de l’absence de symptômes à des résultats cliniques très graves, voire mortels. Des recherches antérieures ont montré qu’un haplotype génétique sur le chromosome 3, qui s’est intégré au génome humain moderne à la suite d’une ancienne conjugaison avec des Néandertaliens, est un facteur de risque important de présentation grave d’infections par le SRAS-CoV-2. Dans ce travail publié dans eLife, réalisé par une équipe internationale de scientifiques comprenant l’adjoint du Pilier 2 Arinjay Banerjee, virologue et scientifique principal à la Vaccine and Infectious Disease Organization (VIDO) à Saskatoon (Saskatchewan), cette région chromosomique a été analysée plus en détail afin de cerner des éléments régulateurs et leurs gènes cibles. L’équipe a utilisé la génétique des populations, la génomique fonctionnelle et des essais expérimentaux pour déterminer, parmi plus de 600 variants, ceux qui étaient des candidats fonctionnels sérieux à l’origine d’une prédisposition génétique à la COVID-19 grave. Quatre candidats sérieux ont été identifiés de cette manière et ont fait l’objet d’une évaluation plus poussée dans le cadre d’essais sur des cellules rapporteuses infectées ou non par le SRAS-CoV-2. Il est probable que ces variants modulent deux gènes essentiels des récepteurs de chimiokines, CCR1 et CCR5. Cette recherche est un excellent exemple de la valeur de l’étude de l’interaction entre la génomique de l’hôte et les résultats cliniques de la COVID-19, et de la façon dont elle peut révéler les facteurs de risque et les trajectoires biologiques importantes liées à la gravité de la maladie.
Regulatory dissection of the severe COVID-19 risk locus introgressed by Neanderthals. Evelyn Jagoda, Davide Marnetto, Gayani Senevirathne, Victoria Gonzalez, Kaushal Baid, Francesco Montinaro, Daniel Richard, Darryl Falzarano, Emmanuelle V LeBlanc, Che C Colpitts, Arinjay Banerjee, Luca Pagani, Terence D Capellini. eLife.2023.02.10.71235; https://elifesciences.org/articles/71235