Services de laboratoire central
Les Services de laboratoire central ont joué un rôle essentiel dans la réussite et la productivité scientifique du Canada pendant la pandémie de COVID-19. Composés de laboratoires dirigés par des membres du réseau CoVaRR-Net à Toronto (laboratoire Gingras | Anne-Claude Gingras; laboratoire Rini | James M. Rini; et laboratoire Wrana | Jeff Wrana) et à Ottawa (laboratoire Langlois | Marc-André Langlois), ces Services de laboratoire central ont été financés en partie par le réseau CoVaRR-Net.
Ces laboratoires ont été appelés « Services de laboratoire central » parce qu’ils constituaient une infrastructure essentielle non seulement pour la plupart des chercheurs du réseau CoVaRR-Net, mais aussi pour de nombreux chercheurs canadiens dans le domaine de la santé pendant la pandémie. Ils ont fourni une infrastructure essentielle, des méthodologies de pointe, des essais standardisés et des réactifs partagés qui ont permis l’évaluation complète des réponses immunitaires et la caractérisation des agents pathogènes par de multiples groupes de recherche.
Ces ressources partagées continuent d’être très rentables, réduisant considérablement la duplication des efforts, des ressources et des dépenses qui se produiraient autrement dans les différents laboratoires. Ils facilitent également la mise en place d’une capacité de réponse rapide, essentielle pour faire face rapidement aux nouvelles menaces qui pèsent sur la santé publique. La centralisation permet d’utiliser des méthodologies standardisées et des réactifs identiques, ce qui améliore considérablement la comparabilité et la fiabilité des résultats d’une étude à l’autre. L’exploitation de ces Services de laboratoire central sophistiqués nécessite un personnel hautement qualifié et spécialisé dans les analyses à haut débit, la mise au point d’essais avancés et le contrôle rigoureux de la qualité. La centralisation de ces ressources garantit un soutien efficace et le maintien de ces ressources humaines essentielles.
Six éléments principaux constituent le fondement de ces services de laboratoire partagés :
1. SÉROLOGIE
Les laboratoires Gingras et Langlois ont mis en place des plateformes automatisées à haut débit pour le dépistage des anticorps contre le SRAS-CoV-2. Utilisant des antigènes produits par le Conseil national de recherches du Canada, ces plateformes ont effectué collectivement plus de deux millions d’essais sur plus de 200 000 échantillons uniques au cours de la pandémie. Ces analyses sérologiques éclairent les études de séroprévalence, permettent de suivre les réponses des anticorps dans le temps et d’identifier les sous-populations dont les réponses à la vaccination ne sont pas optimales, ce qui exercent une influence directe sur les stratégies de santé publique telles que les doses de rappel en temps opportun.
2. TESTS DE NEUTRALISATION DE SUBSTITUTION (snELISA)
Ces tests sont conçus pour mesurer les réponses fonctionnelles des anticorps neutralisants provoquées par la vaccination et l’infection naturelle par le SRAS-CoV-2. Ils permettent une évaluation rapide et à haut débit de l’immunité et de la vulnérabilité potentielle aux nouveaux variants, en s’appuyant sur divers ensembles d’échantillons provenant de la Biobanque CoVaRR-Net et d’activités de surveillance coordonnées.
3. TESTS DE NEUTRALISATION DES PTV
Les tests de neutralisation des particules de type viral (PTV) sont des outils spécifiquement adaptés à l’évaluation des réponses d’anticorps neutralisants contre les nouveaux variants préoccupants (VP) du SRAS-CoV-2. En reproduisant fidèlement les structures virales authentiques sans risque infectieux, ces tests fournissent des informations essentielles sur le potentiel d’échappement immunitaire spécifique à un variant, ce qui est particulièrement important pour l’évaluation des populations présentant une immunité hybride résultant de la vaccination et d’une infection antérieure.
4. SPAR-SEQ POUR LE PROFILAGE DE NOUVEAUX PATHOGÈNES RESPIRATOIRES
Dirigée par Jeff Wrana, la technologie SPAR-Seq constitue une plateforme puissante et à haute résolution capable d’identifier et de caractériser rapidement les variants connus et émergents du SRAS-CoV-2, ainsi que de nouveaux agents pathogènes respiratoires. Cette méthode combine le séquençage à haut débit et le marquage moléculaire par code-barres, ce qui améliore considérablement la rapidité et la précision des activités de surveillance et d’identification des agents pathogènes.
5. GÉNÉRATION DE NOUVELLES CONSTRUCTIONS DE SPICULES DE VARIANTS DU SRAS-COV-2
Le laboratoire Gingras conçoit et produit continuellement de nouvelles constructions pour l’expression des protéines de pointe correspondant aux variants émergents du SARS-CoV-2. Ces constructions constituent des outils essentiels pour la mise au point de tests tels que les neutralisations des PTVs, aidant les chercheurs à comprendre les variants.
6. ANTIGÈNES DE PROTÉINES DE SPICULE
Les équipes dirigées par les chercheurs Gingras et Rini sont spécialisées dans la production en petite quantité d’antigènes de spicules recombinants de haute qualité représentant divers variants du SRAS-CoV-2. Ces antigènes sont essentiels pour une large gamme d’applications, y compris des tests sérologiques, snELISA et des études d’affinité de liaison, facilitant des études complètes sur les réponses immunitaires et les interactions anticorps-antigènes.
Ensemble, ces Services de laboratoire central agissent en collaboration, économisent de l’argent en évitant la duplication des efforts et sont efficaces en tirant parti de l’expertise et des ressources partagées de chacun, ce qui en fait une infrastructure cruciale à maintenir en permanence.