Un interprète de lecture de séquençage universel

Pilier 4
Génomique fonctionnelle et structure-fonction des variants préoccupants

Les progrès rapides de la technologie de séquençage de l’ADN ont révolutionné la recherche biologique, permettant aux scientifiques de mener des expériences complexes qui produisent une grande quantité de données. Le séquençage du génome viral et les tests de fonctionnalité virale ont également été accélérés par le séquençage de l’ADN à haut débit. Les données de séquençage de l’ADN se présentent toutefois sous différents formats, ce qui nécessite un logiciel spécialisé pour les exploiter. Jusqu’à présent, il n’existait pas d’outil souple capable d’interpréter ces différents types de données et de les convertir dans un format adapté à l’analyse. Pour accélérer le séquençage du génome viral et l’essai de neutralisation dans le réseau CoVaRR-Net, nous avons mis au point un outil logiciel polyvalent, INTERSTELLAR. Il peut prendre les données générées par pratiquement n’importe quelle expérience de séquençage de l’ADN et les convertir dans un format que d’autres outils d’analyse peuvent comprendre. Que les données proviennent d’expériences portant sur des cellules uniques ou de la cartographie des gènes actifs dans les tissus, INTERSTELLAR peut les traiter. INTERSTELLAR permet non seulement aux scientifiques d’analyser plus facilement leurs données à l’aide d’un éventail d’outils logiciels, mais il simplifie également l’élaboration de codes et le partage des méthodes d’analyse au sein de la communauté scientifique.

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